这没什么奇怪的，因为在脊椎动物中（甚至扩展到整个脊索动物），卵巢和子宫本身是两个起源不同的器官。
卵巢本身是一个古老的器官，是卵子形成的地方。从无脊椎动物到硬骨辐鳍鱼类，卵巢本身都有属于自己的开口，在卵巢和开口之间有一些或长或短的管道，虽然也被称为“输卵管”，但是它的结构与软骨鱼类和其他四足动物的输卵管非常不同——它是由卵巢本身形成的。
在软骨鱼类、原始硬骨鱼类和随后的四足动物中，输卵管本身并不从卵巢的开口处延伸出来。它来自于中肾管分裂而形成的中肾旁管，也被称为牟勒氏管。由于中肾管的末端在体腔中是开放的，它最初是作为中肾的一部分从体腔中进行过滤和排泄，但在进化过程中被雌性生殖系统说吧“借用”，从而成为 了雌性生殖细胞的通道。在一些脊椎动物中，输卵管的中部膨大而形成子宫。可以看出，卵巢和输卵管来自不同的来源，很容易理解，他们两者应该没有连通。
然而，在人体内，卵巢和输卵管伞部其实没有什么间隙，因为伞状部分是包覆在卵巢上。宫外孕这种异位妊娠更有可能发生在输卵管内，而腹部妊娠（卵子在没有进入输卵管的情况下就受精和着生发育了）的概率只有大约1/20,000。此外，在早期的雄性脊柱动物中，中肾管不仅作为排泄的通道，而且作为精巢排精的管道。因此随着演化的进行，中肾管分出了负责雌性生殖细胞运输的牟勒氏管，而另一支仍与精巢相连的中肾管（被称为吴氏管）被保留下来，成为了现在脊椎动物中的输精管。这就是输精管与睾丸相连的原因。
从图中可见，在早期人类胚胎（上，近似看做早期脊索动物）中，精巢和吴氏管（中肾管）相通，而卵巢和作为中肾旁管的牟勒氏管并不相通。发育成熟的雄性生殖 系统中（左下），牟勒氏管退化，吴氏管演化为和睾丸直接相连的输精管。而在雌性生殖系统中（右下），吴氏管退化，牟勒氏管发育为输卵管，并且下部膨大形成 子宫。
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